Sur les ordinateurs Windows, CM Server est lancé à l'amorçage du système par le gestionnaire de contrôle des services Windows et s'exécute sous l'identité du compte intégré LocalSystem (NT AUTHORITY\SYSTEM). CM Server peut accéder aux ressources pour lesquelles il ne dispose pas d'autorisation d'accès lors d'une exécution avec l'identité du compte utilisateur intégré. Par exemple, CM Server peut accéder à un fichier de clés SSH stocké dans un répertoire partagé.