O sistema suporta o uso de HTTPS para proteger a comunicação entre o navegador e o Rational DOORS Web Access Server. Atualmente não há suporte para comunicação segura entre diferentes componentes do lado do servidor.
É possível proteger a comunicação usando estratégias de segurança reconhecidas, como firewalls. Os usuários do Web client normalmente apenas precisam ter acesso direto à porta do Rational DOORS Web Access Server.