Deze optie bepaald of de domein eigenaar toegang heeft tot de Eigen Opdrachten Webmin module. Met de Eigen Opdrachten module kunt u de mogelijkheden in Webmin uitbreiden zonder een nieuwe module te moeten programmeren. Een eigen opdracht kan worden uitgevoerd net als iedere opdracht op het systeem met alle opties die u specificeert. Variabele vervanging is ook beschikbaar zodat de gebruiker die de opdracht uitvoert extra input of optionele argumenten kan geven aan de opdracht, en het is mogelijk de opdracht uit te voeren als ingelogde Webmin gebruiker, of als iedere gebruiker op het systeem (inclusief root, maar wees dan voorzichtig !). Dit is een hele krachtige optie van Webmin waarmee u ook extra "knoppen" kunt toevoegen waaronder special functies zitten om te gebruiken in uw omgeving, of om sommige gebruikers ergens toegang naar te geven.